http://overthenejm.blog7.fc2.com/ ドクターのあなたなら、迷わず医学英語でレバレッジ！The New England Journal of Medicineで世界へ！ ja http://overthenejm.blog7.fc2.com/blog-entry-278.html 前回の続きです。いよいよ、統計方法の話に入ります。Time-to-event analyses were performed with the use of life-table methods according to the intention-to-treat principle. (N Engl J Med 2009;361:2019-32.)life-table methods　生命表の方法the intention-to-treat principle　　このintention-to-treat (ITTなどと略されることもある）、私にはなかなかわかりにくかったのですが、「本当はやさしい臨床統計」を読んで いよいよ、統計方法の話に入ります。

Time-to-event analyses were performed with the use of life-table methods according to the intention-to-treat principle. (N Engl J Med 2009;361:2019-32.)

life-table methods　生命表の方法
the intention-to-treat principle　
　このintention-to-treat (ITTなどと略されることもある）、私にはなかなかわかりにくかったのですが、「本当はやさしい臨床統計」を読んですっきり理解できました。つまり、以下の通りです。
「実際にAという治療を受けた群と、Bという治療を受けた群」
を比較するのではなく、
「Aという治療法を受ける（行う）意図をもった群とBという治療法を受ける（行う）意図をもった群」
を比較した情報に基づいて判断すること
（臨床医による臨床医のための本当はやさしい臨床統計. p-16-17より）
なるほどー、そういうことだったのかー。

Kaplan–Meier cumulative incidence curves were compared with the use of a two-sided log-rank test, stratified according to the baseline proteinuria level and the presence or absence of a history of cardiovascular disease. (N Engl J Med 2009;361:2019-32.)

Kaplan–Meier cumulative incidence curves Kaplan-Meierの生存曲線
a two-sided log-rank test　Log-rank検定
このあたりは、定番の流れのようです。それぞれについては現在、勉強中です...

Estimated hazard ratios (for darbepoetin alfa vs. placebo) and 95% confidence intervals were obtained with the use of stratified Cox proportional-hazards models. (N Engl J Med 2009;361:2019-32.)

stratified Cox proportional-hazards models　Coxの比例ハザードモデル
これもまた定番。そして、勉強中です...

勉強の進展に伴い、ここに書く内容も深化する予定です。今回のところは、これにて。
あんまりお役に立ってなくて、ごめんなさい。

NEJMのサイトはThe New England Journal of Medecineで見られます。abstractは無料で閲覧できますから、どうぞ。
抄録の日本語版は南江堂サイトへ。

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]]> Further Reading 2009-11-25T06:39:26+09:00 Dr. Joy Planter FC2-BLOG http://overthenejm.blog7.fc2.com/blog-entry-277.html 英語がわからなければ英語文献は読めないわけですが、英語が読めればその文献は理解できるのか、というと、それはそうではありませんね。これまでずっと抄録を中心に読んできました。「英文」としては読みこなしてきたつもりですが、内容まで、特に統計的な内容まで踏み込んではいませんでした。統計には明るくないので、スルーしてきましたが、この際、勉強してみることにします。現在、使用中のテキストはこちら。臨床医による臨 これまでずっと抄録を中心に読んできました。「英文」としては読みこなしてきたつもりですが、内容まで、特に統計的な内容まで踏み込んではいませんでした。
統計には明るくないので、スルーしてきましたが、この際、勉強してみることにします。
現在、使用中のテキストはこちら。
臨床医による臨床医のための本当はやさしい臨床統計―一流論文に使われる統計手法はこれだ! (EBMライブラリー)　野村秀樹/松倉知晴著、中山書店　（以下、「本当はやさしい臨床統計）
まずは、週１本統計処理が記載されている論文を選び、詳しく読んでみます。
無料閲覧論文ばかりにはならないので、興味があれば本誌を手にとって見てください。なお、定期購読者はOnlineで全文閲覧できます。

ではまず、第１回目はこちら。リンクはAbstractに貼っています。
A Trial of Darbepoetin Alfa in Type 2 Diabetes and Chronic Kidney Disease (N Engl J Med 2009;361:2019-32.)

本文のMETHODSを中心に見てみます。
まず、研究デザイン。
The TREAT was a randomized, double-blind, placebo-controlled trial conducted at 623 sites in 24 countries (see the Supplementary Appendix, available with the full text of this article at NEJM.org). (N Engl J Med 2009;361:2019-32.)
　ランダム化二重盲検比較試験を行っています。

次に、必要対象者数を出すパワー計算を見ます。
パワー計算というのは、「どの程度の差があれば臨床的に意味があると考えるかを決める」のに必要なサンプル（いわゆるn)の数を指します（「本当はやさしい臨床統計」より）。
これはStatistical Analysisに書かれていました。
The trial was event driven, with a total of 1203 cardiovascular composite events required to provide 80% statistical power to detect a 20% risk reduction for this outcome, with a two-sided type I error of 0.048 (unadjusted for interim analyses). We aimed to enroll approximately 4000 patients; assumptions included an annualized rate of events in the placebo group of 12.5%, a 15% loss to follow-up, and attenuation of the treatment effect due to the anticipated use of ESAs in patients who had progression to end-stage renal disease. (N Engl J Med 2009;361:2019-32.)
(追記）
「本当はやさしい臨床統計」によれば、nの数はこうして決まります。
1. アウトカムの種類:二者択一か、連続量か
2. 許容できるαエラーとβエラーの範囲
3. 「臨床的に意義がある」と考える差の大きさ
4. アウトカム測定上のばらつき（分散、標準偏差）...連続量のみ
5. 実験群と対照群のnの非：実験群１に対して対照群１が最も効率的
（臨床医による臨床医のための本当はやさしい臨床統計 野村秀樹/ 松倉知晴著）
これで当てはめると、
1. 二者択一
2. αエラー: 0.048、βエラー:0.20
3. 20%のリスク減少
というところまで、わかります。
その次には、何を一次エンドポイントとしたかを見ます。
Evaluation of Outcomes
The primary end points were the time to the composite outcome of death from any cause or a cardiovascular event (nonfatal myocardial infarction, congestive heart failure, stroke, or hospitalization for myocardial ischemia) and the time to the composite outcome of death or end-stage renal disease (see the Supplementary Appendix). (N Engl J Med 2009;361:2019-32.)
　一次エンドポイントは「何らかの原因あるいは心血管イベントによる死亡を複合アウトカムとした時間」と「死亡あるいは末期腎疾患を複合アウトカムとした時間」となっています。それぞれについては、
The overall alpha level for the primary end points was split: 0.048 for the cardiovascular composite outcome and 0.002 for the renal composite outcome. (N Engl J Med 2009;361:2019-32.)
αエラー値を変えて設定してますね。

本日はここまで。
統計の部分については次回に。

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]]> Further Reading 2009-11-24T06:56:10+09:00 Dr. Joy Planter FC2-BLOG http://overthenejm.blog7.fc2.com/blog-entry-276.html NEJM Nov. 19号の原著論文抄録を読み終わったのでオーディオサマリーを聞いてみましょう。下記のタイトルをクリックすると、オーディオサマリーが開きます。Supplement to the New England Journal of Medicine, Vol. 361, No. 21. 下記のタイトルをクリックすると、オーディオサマリーが開きます。
Supplement to the New England Journal of Medicine, Vol. 361, No. 21. ]]> PODCAST 2009-11-23T08:20:07+09:00 Dr. Joy Planter FC2-BLOG http://overthenejm.blog7.fc2.com/blog-entry-275.html 新型インフルエンザのタミフル耐性獲得や強毒化が危惧されています。生物は全て、環境変化に対抗して自分を変化させていきます。ヒトとて同じ。今回は、あのプリオン病として有名なKuru病とヒトとの見えざる戦いがテーマです。下記のタイトルをクリックすると抄録が開きます。A Novel Protective Prion Protein Variant that Colocalizes with Kuru Exposure (N Engl J Med 2009;361:2056-65.) 今回は、あのプリオン病として有名なKuru病とヒトとの見えざる戦いがテーマです。
下記のタイトルをクリックすると抄録が開きます。
A Novel Protective Prion Protein Variant that Colocalizes with Kuru Exposure (N Engl J Med 2009;361:2056-65.) ]]> ABSTRACT 2009-11-22T07:20:52+09:00 Dr. Joy Planter FC2-BLOG http://overthenejm.blog7.fc2.com/blog-entry-274.html Inflammatory Bowel Disease and Mutations Affecting the Interleukin-10 Receptor (N Engl J Med 2009;361:2033-45.)については既にOnline Firstの段階で読んでしまいました。手持ちが少なくても踏みとどまる: 10.1056/NEJMoa0907206.だからここはとばして、次を読みましょう。下記のタイトルをクリックすると抄録が開きます。Combined Immunodeficiency Associated with DOCK8 Mutations (N Engl J Med 2009;361:2046-55.) Inflammatory Bowel Disease and Mutations Affecting the Interleukin-10 Receptor (N Engl J Med 2009;361:2033-45.)
については既にOnline Firstの段階で読んでしまいました。
手持ちが少なくても踏みとどまる: 10.1056/NEJMoa0907206.
だからここはとばして、次を読みましょう。
下記のタイトルをクリックすると抄録が開きます。
Combined Immunodeficiency Associated with DOCK8 Mutations (N Engl J Med 2009;361:2046-55.) ]]> ABSTRACT 2009-11-21T07:27:32+09:00 Dr. Joy Planter FC2-BLOG